A CIRP está organizada em estruturas a nível nacional e local.
A nível nacional, tem os seguintes organismos: como órgãos de governo, a Assembleia Geral, a Direcção e o Conselho Fiscal; como órgãos que colaboram e apoiam os órgãos de governo, o Secretariado Geral e as Comissões Nacionais.

Direção da CIRP (2023/2026)

Da esquerda para a direita: Ir. Célia Cabecinhas – vogal; Ir. Ângela Coelho – Vice-Presidente; P. Adelino Ascenso – Presidente; Ir. Maria Alzira Ferreira – Vogal; P. Rui Santiago – Vogal

Presidente:
Padre Adelino Ascenso (Sociedade Missionária da Boa Nova)

Vice-Presidente:
Irmã Ângela de Fátima Coelho da Rocha Pereira da Silva (Aliança de Santa Maria

Vogais:
Irmã Alzira Rodrigues Ferreira (Irmãs Dominicanas de Santa Catarina de Sena)
Irmã Célia Maria Pedrosa Cabecinhas (Irmãs Concepcionistas ao Serviço dos Pobres)
Padre Rui Filipe Santiago (Padres Redentoristas

Secretariado-Geral

Secretário-Geral:
Padre Constantino Tiago Espírito Santo (Sacerdotes do Coração de Jesus – Dehonianos)

Ecónomo:
Padre Manuel Joaquim Gomes Barbosa (Sacerdotes do Coração de Jesus – Dehonianos

Conselho Fiscal

Presidente:
Irmã Maria Conceição d’Oliveira Fernandes (Irmãs de São João Baptista e de Maria Rainha)

Secretário:
Irmão António Leal das Neves Jorge (Irmãos Maristas)

Vogal:
Irmã Maria de Fátima Fernandes Machado (Irmãs de São José de Cluny)